Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtprfA2A8L5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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