Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb4A2A863 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms