Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Hdac5Q9Z2V6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Hdac5Q9Z2V6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Hdac5Q9Z2V6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Hdac5Q9Z2V6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Hdac5Q9Z2V6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hdac5Q9Z2V6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms