Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ubl3Q9Z2M6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ubl3Q9Z2M6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ubl3Q9Z2M6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms