Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms