Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms