Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn7Q9Z261 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn7Q9Z261 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms