Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn8Q9Z260 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms