Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms