Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pard6aQ9Z101 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pard6aQ9Z101 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms