Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cldn9Q9Z0S7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cldn9Q9Z0S7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cldn9Q9Z0S7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Cldn9Q9Z0S7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Cldn9Q9Z0S7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn9Q9Z0S7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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