Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek3Q9R0A5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek3Q9R0A5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek3Q9R0A5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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