Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Col4a3Q9QZS0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Col4a3Q9QZS0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms