Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a4Q9QZR9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a4Q9QZR9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms