Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ercc4Q9QZD4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ercc4Q9QZD4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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