Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms