Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tomm40Q9QYA2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms