Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms