Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Rad18Q9QXK2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rad18Q9QXK2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad18Q9QXK2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms