Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Limd1Q9QXD8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limd1Q9QXD8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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