Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rabgef1Q9JM13 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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