Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CubnQ9JLB4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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