Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms