Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ldb3Q9JKS4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms