Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chrac1Q9JKP8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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