Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Riox1Q9JJF3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Riox1Q9JJF3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms