Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl28Q9JIL2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl28Q9JIL2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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