Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtofQ9ESF1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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