Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tfcp2Q9ERA0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms