Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SgshQ9EQ08 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SgshQ9EQ08 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms