Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gpr88Q9EPB7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms