Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rsph3bQ9DA80 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rsph3bQ9DA80 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rsph3bQ9DA80 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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