Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp12Q9D9M2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp12Q9D9M2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms