Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Nop56Q9D6Z1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nop56Q9D6Z1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nop56Q9D6Z1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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