Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tube1Q9D6T1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tube1Q9D6T1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms