Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms