Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap53Q9D439 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap53Q9D439 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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