Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx29Q9D3S3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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