Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Snapc3Q9D2C9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms