Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Mrpl53Q9D1H8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl53Q9D1H8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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