Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms