Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed3Q9D0L1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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