Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ChtopQ9CY57 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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