Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sgo1Q9CXH7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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