Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnot11Q9CWN7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms