Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
NubplQ9CWD8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
NubplQ9CWD8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms