Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcf1Q9CTH6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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