Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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