Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atg12Q9CQY1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Atg12Q9CQY1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms