Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ifitm3Q9CQW9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms